佛罗里达大学植物学理学硕士项目的研究方向包括生态学、进化、行为学、发育、比较和环境生理学、分子生物学、神经生物学、遗传学和系统发育学等。研究范围小到基因组大到生态系统分析。佛罗里达大学植物学理学硕士项目的教授正在对各种陆地和水生环境、跨地理区域（热带到近极）以及各种生物体进行研究。佛罗里达大学植物学理学硕士项目除了提供理论知识教学外也安排实验室和实地研究的实践活动。