布朗大学计算机科学系研究生阶段开设有MS和PhD学位项目，注意：这两个项目为相对独立的项目，学生在攻读PhD学位过程中，满足硕士学位授予条件，可授予MS学位，但申请MS的学生入学后，不可转而攻读PhD。
| 序号 | 课程介绍 | Curriculum |
| 1 | 算法与理论 | Algorithms and Theory |
| 2 | 人工智能 | Artificial Intelligence |
| 3 | 计算生物学 | Computational Biology |
| 4 | 计算经济学 | Computational Economics |
| 5 | 计算机系统 | Computer Systems |
| 6 | 计算机视觉 | Computer Vision |
| 7 | 计算教育 | Computing Education |
| 8 | 数据科学 | Data Science |
| 9 | 数据库系统 | Database Systems |
| 10 | 分布式系统 | Distributed Systems |
| 11 | 图形与可视化 | Graphics and Visualization |
| 12 | 人机交互 | Human-Computer Interaction |
| 13 | 机器学习 | Machine Learning |
| 14 | 编程语言 | Programming Languages |
| 15 | 机器人 | Robotics |
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