生物信息学主要研究计算机方法在生物过程中的应用。爱丁堡大学生物信息学理学硕士项目向学生传授现代高通量技术下大数据的解释方法，使学生在生物学背景之上掌握一定的计算技能及生物数据知识。核心课程包括课程包括编程技巧、统计分析和数据库科学及生物信息，而选修课程帮助学生全面拓展生物信息学的相关知识，学生毕业后或从事实务工作，或继续攻读生物信息学博士。
| 序号 | 课程介绍 | Curriculum |
| 1 | 生物信息学程序设计与系统管理 | Bioinformatics Programming and System Management |
| 2 | 统计与数据分析 | Statistics and Data Analysis |
| 3 | 研究计划（生物信息学） | Research Proposal (Bioinformatics) |
| 4 | 理学硕士（生物信息学） | MSc Dissertation (Bioinformatics) |
| 5 | Java编程导论 | Introduction to Java Programming |
| 6 | 人机交互（11级） | Human-Computer Interaction (Level 11) |
| 7 | 生物信息学1 | Bioinformatics 1 |
| 8 | 分子建模与数据库挖掘 | Molecular Modelling and Database Mining |
| 9 | 定量药物结合 | Quantitating drug binding |
| 10 | 生物细胞的信息处理 | Information Processing in Biological Cells |
| 11 | 实用系统生物学 | Practical Systems Biology |
| 12 | 下一代基因组学 | Next Generation Genomics |
| 13 | 生物信息学2 | Bioinformatics 2 |
| 14 | 分子系统学 | Molecular Phylogenetics |
| 15 | 生物信息学算法 | Bioinformatics Algorithms |
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