新加坡国立大学水利工程与水资源管理硕士学位课程由土木与环境工程系开设，要求学生必须至少修读40个学分，同时修读新加坡国立大学土木与环境工程系开设的不少于30个学分的研究生课程或相关学科课程。新加坡国立大学水利工程与水资源管理硕士学位课程的学生必须事先征得土木与环境工程系主任或其他管理人员的同意才能修读其他模块的学分。同时，新加坡国立大学水利工程与水资源管理硕士学位课程的学生现在可以申请参加代尔夫特理工大学的交流项目。
| 序号 | 课程介绍 | Curriculum |
| 1 | 水波动力学与物理海洋学 | Wave Hydrodynamics and Physical Oceanography |
| 2 | 海岸演变与沉积物迁移 | Coastal Processes and Sediment Transport |
| 3 | 水利信息学 | Hydroinformatics |
| 4 | 计算机环境建模 | Environmental Modelling with Computers |
| 5 | 河流力学 | River Mechanics |
| 6 | 地下水水文学 | Groundwater Hydrology |
| 7 | 工程经济学与项目评估 | Engineering Economics and Project Evaluation |
| 8 | 浮动结构设计 | Design of Floating Structures |
| 9 | 海上系泊与冒口 | Offshore Moorings and Risers |
| 10 | 水处理工艺 | Water Treatment Processes |
| 11 | 环境管理系统 | Environmental Management Systems |
| 12 | 环境技术 | Environmental Technology |
| 13 | 水政策与治理 | Water Policy and Governance |
| 14 | 水利工程与水资源管理项目 | HEWRM Project |
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